超微粉碎機通過對物料的沖擊，碰撞，剪切，研磨，分散等手段而實現。傳統粉碎中的擠壓粉碎方法不能用于超微粉碎，否則會產生造粒效果。選擇粉碎方法時，須視粉碎物料的性質和所要求的粉碎比而定，尤其是被粉碎物料的物理和化學性能具有很大的決定作用，而其中物料的硬度和破裂性更居首要地位，對于堅硬和脆性的物料，沖擊很有效；而對中藥材用研磨和剪切方法則較好。實際上，任何一種粉碎機器都不是單純的某一種粉碎機理，一般都是由兩種或兩種以上粉碎機理聯合起來進行粉碎，如氣流粉碎機是以物料的相互沖擊和碰撞進行粉碎；高速沖擊式粉碎機是沖擊和剪切起粉碎作用；振動磨，攪拌磨和球磨機的粉碎機理則主要是研磨，沖擊和剪切；而膠體磨的工作過程主要通過高速旋轉的磨體與固定磨體的相對運動所產生的強烈剪切，摩擦，沖擊等等。
隨著保健食品技術的不斷發展，以往普通的粉碎手段已越來越不適應生產需要。作為一種高新技術加工方法，超微粉碎技術已運用到許多保健食品的加工生產中。許多可食動植物、微生物，甚至動植物的不可食部分都可通過超微化后被人體吸收。經微細化的食品具有很強的表面吸附力和親和力。因此，具有很好的固香性、分散性和溶解性，容易為人體所吸收消化。
植物原料經過超微粉碎后，顯微鏡下觀察結果顯示，僅有極少量完整細胞存在。細胞破壁后，細胞內的有效成分充分暴露出來，其釋放速度及釋放量會大幅度提高，人體吸收則較為容易。物料進入胃后，可溶性成分在胃液的作用下溶解，進入小腸后溶解的成分開始被吸收。由于物料為超細粒子，其不溶性成分易附著在腸壁上，有效成分會很快的通過腸壁吸收，進入血液。而且這些超微粒子因附著力的影響排出體外所需時間較長，提高了有效成分的吸收率。
